NIK każdego roku przeprowadza setki kontroli. W ubiegłym roku było ich w sumie 385. Statystycznie dominowały kontrole doraźne, jednak to audyty planowe angażowały inspektorów w największym stopniu. Poświęcili im 84 proc. rocznego czasu pracy. Kontrole doraźne stanowiły jego mniejszą część - niespełna 16 proc.
Kontrole doraźne to przeważnie przedsięwzięcia jednostkowe, czyli przeprowadzane przez jedną komórkę organizacyjną NIK (departament bądź delegaturę). Kontrole planowe to często audyty koordynowane, a więc takie, w których uczestniczy kilka bądź kilkanaście jednostek NIK, kontrolujących wspólnie po kilkadziesiąt instytucji. Są to więc przedsięwzięcia wymagające znacznie większego nakładu pracy niż audyty doraźne. Największą kontrolą planową, przeprowadzaną corocznie przez NIK, jest kontrola budżetowa, w której uczestniczą wszystkie departamenty kontrolne Izby oraz delegatury - łącznie 24 jednostki.
Efekty pracy inspektorów NIK zawarte są m.in. w informacjach o wynikach kontroli. W zeszłym roku Izba przedłożyła Sejmowi blisko 200 raportów, które stanowiły kompendium wiedzy na temat stanu państwa. Ponad połowa z nich to informacje o wykonaniu budżetu, pozostałe dotyczyły m.in. budownictwa, gospodarki przestrzennej i mieszkaniowej, finansów publicznych, administracji, oświaty, bezpieczeństwa obywateli oraz służby zdrowia.
